Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P3Q13401 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms