Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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