Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACACAQ13085 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms