Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
POLEQ07864 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLEQ07864 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms