Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms