Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms