Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms