Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms