Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms