Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms