Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms