Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms