Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSDMDP57764 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms