Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms