Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6CP51160 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms