Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms