Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZEB1P37275 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms