Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms