Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms