Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PTPRMP28827 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PTPRMP28827 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PTPRMP28827 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PTPRMP28827 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRMP28827 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRMP28827 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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