Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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