Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms