Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms