Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRM3P20309 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms