Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NFKB1P19838 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NFKB1P19838 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NFKB1P19838 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NFKB1P19838 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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