Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XBP1P17861 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XBP1P17861 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XBP1P17861 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XBP1P17861 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XBP1P17861 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XBP1P17861 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XBP1P17861 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XBP1P17861 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XBP1P17861 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XBP1P17861 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
XBP1P17861 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XBP1P17861 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms