Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPB42P16452 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPB42P16452 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPB42P16452 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPB42P16452 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPB42P16452 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EPB42P16452 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EPB42P16452 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EPB42P16452 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPB42P16452 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EPB42P16452 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPB42P16452 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms