Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH1P12830 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms