Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms