Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC192P0DO97 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms