Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FAM58BPP0C7Q3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FAM58BPP0C7Q3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FAM58BPP0C7Q3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FAM58BPP0C7Q3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM58BPP0C7Q3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FAM58BPP0C7Q3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM58BPP0C7Q3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FAM58BPP0C7Q3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM58BPP0C7Q3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM58BPP0C7Q3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM58BPP0C7Q3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM58BPP0C7Q3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM58BPP0C7Q3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM58BPP0C7Q3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM58BPP0C7Q3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM58BPP0C7Q3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM58BPP0C7Q3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM58BPP0C7Q3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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