Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APODP05090 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APODP05090 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APODP05090 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APODP05090 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APODP05090 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APODP05090 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APODP05090 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APODP05090 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APODP05090 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APODP05090 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APODP05090 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APODP05090 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APODP05090 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APODP05090 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms