Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms