Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCATO75600 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCATO75600 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms