Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms