Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms