Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-2B6SEH9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms