Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms