Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms