Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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