Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLF13Q9Y2Y9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLF13Q9Y2Y9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms