Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCML1Q9UN30 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCML1Q9UN30 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCML1Q9UN30 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms