Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms