Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKSQ9UJT2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms