Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RABGEF1Q9UJ41 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1Q9UJ41 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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