Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms