Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCF2Q9UG63 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms