Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms