Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms