Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms